Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg4bQ8BGE6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg4bQ8BGE6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms