Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34b3Q80ZS5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34b3Q80ZS5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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