Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Alkbh8Q80Y20 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh8Q80Y20 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh8Q80Y20 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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