Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgo2Q7TSY8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgo2Q7TSY8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms