Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ckap2lQ7TS74 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ckap2lQ7TS74 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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