Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LnpkQ7TQ95 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms