Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms