Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms