Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Cxcl3Q6W5C0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxcl3Q6W5C0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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