Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms