Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rasa4Q6PFQ7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms