Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rad54bQ6PFE3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rad54bQ6PFE3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rad54bQ6PFE3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rad54bQ6PFE3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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