Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbtb39Q6PDK0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms