Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC061212Q6P8K3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC061212Q6P8K3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms