Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rrp12Q6P5B0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms