Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mvb12bQ6KAU4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mvb12bQ6KAU4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms