Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt39Q6IFX4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt39Q6IFX4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms