Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgap20Q6IFT4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms