Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms