Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fnip1Q68FD7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms