Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctnna3Q65CL1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms