Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn1Q64347 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clcn1Q64347 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms