Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt12Q64291 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms