Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms