Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms