Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc18Q640L5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc18Q640L5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms