Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lcn4Q62472 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn4Q62472 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lcn4Q62472 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn4Q62472 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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