Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20865Q62460 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms