Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcncQ62447 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcncQ62447 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms