Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SypQ62277 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SypQ62277 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SypQ62277 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SypQ62277 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SypQ62277 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SypQ62277 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SypQ62277 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SypQ62277 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SypQ62277 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SypQ62277 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SypQ62277 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SypQ62277 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SypQ62277 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SypQ62277 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms