Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Sprr1bQ62267 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms