Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Sema5aQ62217 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sema5aQ62217 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sema5aQ62217 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema5aQ62217 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms