Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprrQ62132 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprrQ62132 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprrQ62132 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprrQ62132 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprrQ62132 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprrQ62132 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprrQ62132 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtprrQ62132 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtprrQ62132 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprrQ62132 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprrQ62132 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprrQ62132 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprrQ62132 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprrQ62132 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprrQ62132 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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