Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lama3Q61789 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lama3Q61789 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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