Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms