Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EsrrbQ61539 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EsrrbQ61539 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms