Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cln3Q61124 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms