Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp4Q61107 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms