Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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JrkQ60976 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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JrkQ60976 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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