Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms