Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm1Q60636 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms