Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp13a3Q5XF89 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms