Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Rtl5Q5DTT4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rtl5Q5DTT4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtl5Q5DTT4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtl5Q5DTT4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtl5Q5DTT4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rtl5Q5DTT4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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