Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fam208bQ5DTT3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam208bQ5DTT3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms