Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Snhg11Q4G0K9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Snhg11Q4G0K9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms