Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Syne3Q4FZC9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms