Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms