Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933416C03RikQ3V063 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms