Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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BB287469Q3UT53 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
BB287469Q3UT53 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BB287469Q3UT53 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BB287469Q3UT53 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BB287469Q3UT53 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BB287469Q3UT53 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BB287469Q3UT53 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BB287469Q3UT53 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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BB287469Q3UT53 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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BB287469Q3UT53 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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BB287469Q3UT53 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BB287469Q3UT53 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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