Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nlrc4Q3UP24 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrc4Q3UP24 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms